理藩院的档案对于国内各少数民族情况以及当时藩属与中央朝廷的关系，是第一手的史料。总理各国事务衙门档案和宪政编查馆的档案，对于研究近代中外关系，以及清末宪政运动，都是必不可少的。



三、盛京档案和奉天档案

辽宁省档案馆保藏的盛京档案，严格说来，亦可算是中央朝廷档案的一个分支。因为所谓盛京，即今日的沈阳，本来是满洲族崛起之地。在进入关内，建立全国性统一政权之前，清太祖努尔哈赤和清太宗皇太极，都曾以此作为后金和清国的政权中心。清朝建立之后，认为沈阳是“龙飞之地”，意义重大，故立为陪都。名为盛京。在盛京内仿照中央朝廷的体制，设立盛京内务府，专门负责管理和维护皇家祖宗的陵寝、原有的宫殿、在关外地区的皇庄土地、财务皇产等，亦为历届皇帝定期回来祭祀祖先时服务。在盛京还设有除吏部以外的户、礼、兵、刑、工五部以分管本地区的各项政务。亦表示盛京具有的陪都地位，这是任何其它城市所不能比拟的。之所以不设吏部，是因为认为人事方面的官员任免升黩贬降等应由北京吏部统一处理，不宜再作划分。在盛京还设有奉天将军，是负责本地区军政的最高级官员。

正是由于盛京地区在清代拥有的特殊地位，所以辽宁省档案馆的明清档案藏件，也具有本身的特点，它是除中国第一历史档案馆之外，保存明清档案数量最多，内容最丰富的“大户”。

辽宁省档案馆由于历史的原因，还保存有唐代的档案6件，是在开元二年（公元714年）形成的，内容是关于追剿“寇贼”的公文和某一寺院法师的名单。这六件唐档是在甘肃敦煌石窟中发现的，本由罗振玉先生保存，现移交给辽宁省档案馆。

该馆保存的明代档案有1081卷，期限从明初洪武二十五年（公元1392年）至明末崇祯十六年（公元1643年），可说与有明一代相终始。其中，又以明代中期的嘉靖、隆庆、万历年间的居多，主要以辽东都指挥使司、山东等处总督备倭署、兵部衙门的文件为主，内容涉及地方军务、民政、社会经济、司法、民族关系、土地、人丁赋役、军丁招募、逃亡追缉等问题，其中还有隆庆万历间名将戚继光的亲笔批示。在这批明代档案中，有一部份曾被当时的满族作为俘获品，将之裁剪开作为屏风用料，或缝垫以作为马鞍用料，这反映出处在刚崛起时期满族的认识，以及当时明满和战的史实。习惯上称之为屏风档或马鞍档。

辽宁省档案馆共存清代档案16万余卷，分别为盛京中央机关和奉天地方机关军、政、旗务的档案，包括满文老档、黑图档（黑图、满语为副本的意思，其中又分为京来、京行，即与北京有关部门间的来往公文书；部来、部行，即与盛京五部间的来往公文书。）还有大事记、谱牒、八旗官兵旗别户口、地亩、生息银两、祭祀典则等等文件。其中又可细分为盛京内务府档、盛京将军档、三姓（今黑龙江依兰县）副都统衙门档、晚清奉天交涉总局档、奉天巡警道档等。
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