首先，四川巴县历史悠久，地位重要。巴县地处大西南四川盆地的东南部,县境辽阔,为嘉陵江、长江的汇合口，政治、经济、军事位置重要，是四川东部政治、经济、军事、文化的中心。早在原始社会的氏族部落时，就有古巴国之称。巴县命名始于北周明帝武成三年（公元561年），距今至少已1400年以上。历来巴国、巴郡、川东道、重庆府的都城、治城均设在巴县境内。但人们相沿成习，仍叫重庆城。此时的重庆城有名无实，而巴县城则有实无名.
四川素有“蜀道之难难于上青天”，陆路交通不便，进出四川，全凭长江。巴县为南下北上必经之路，通商航运的枢纽。南来北往的货物、东下西上的物资，皆在巴县境内吞吐集散，运往全川和整个大西南，经济区域优势明显。
其次，清代四川巴县衙门司法档案时间久远，数量大，内容丰富完整。清代四川巴县衙门司法档案形成于清乾隆元年（1736年）至清宣统三年（1911年），历经封建社会沦为半封建、半殖民地社会的巨变时期；数量有11.3万余卷，从文件形成来看，不仅有巴县自身形成的文件，还有大量的省、道、府下发的及其它各州县的来往文件。因之这部分档案记录了清明时期的内政、外交、财政、经济、军事、文化、司法等情况，是研究清代重庆、四川和我国西南地区历史、城市发展史、区域经济的重要史料。
第三，清代四川巴县衙门司法档案浩瀚卷帙，囊括的不仅仅是历史学研究的对象与内容，它更为广泛丰富地包容了社会科学的各方面，涉及城乡社会经济的各个领域，为清代区域经济史、社会经济史的研究提供了一个新的范例；同时为人们研究清代县级地方的行政制度、司法制度、军事制度以及清代政府的经济、宗教、民族政策，有着重要的参考价值。
1979年四川大学历史系教授伍仕谦在他发表题为《一座内容丰富的文献宝库——巴县档案》和《关于巴县档案》两文中，对巴县档案有详细评价，他多处指出“巴县档案内容丰富”，“涉及的社会历史和范围很广”、“反映许多重要情况”“对我国史学界研究清史、中国近代史、现代史具有极大的参考价值。是研究四川地方史极为重要的资料”。还指出：这部分档案对研究我国近代经济史、气象史、农田水利史、官制史。基层政权发展史都有很大的参考价值,是研究历史不可缺少的东西。美国哥伦比亚大学副教授曾小萍,看了清代巴县有关经济的档案后说：巴县档案对于研究地方太重要了”。我国的经济史专家指出：“各地地方文献，如巴县档案、徽州资料的整理出版，为区域经济史的发展开辟了广阔的道路。新中国成立以后，明清史资料建设取得重大进步，其突出表现是：一批对史学研究至关重要的档案文书，如，徽州文书、巴县档案、孔府档案，特别是中国第一历史档案馆馆藏档案被整理、公布，从而为史学界深入考察明清历史奠定了重要的资料基础。”
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